Warning! We strongly recommend Internet Explorer (9.0 and later) and Google Chrome for better display.

Gene detail [Fasta]

Species Pediculus humanus
GenePHUM558900
PositionDS235861:164435..180601[GBrowse]
VectorBasehttp://www.vectorbase.org/search/site/PHUM558900
Gene Expressionhttps://www.vectorbase.org/expression-browser/gene/PHUM558900
sequence mRNA:
>PHUM558900-RA
ATGGGTTGCGGAGTGACGTTCGTCGATAAATTTCTCACCCGTAATTTTTTCCGTTTGGGAATGTTCGTGGGTAAAAATCC
CGGATATTTTCTCATAATACCCATATTGGTCGCGTTGTTATGCCTCACGGGACGATTTGGAAGAATCATAGCCATTCCAA
GGGACAAGGGAGACATGTTGAGAGTTGAAATATGGAAAGAATTAAGACTACTCGATGAATTGATACAAAACACGACAGCA
GAATACGAGGGTGAAACGTTTACATATCGCGAAGTGTGCGCCAAATGGATAAACGAATGTTTTCAAAATGACATATTAAA
TTTAGACTACGTAATGGAAGACATTGAATCGAAAGAATTAAATTTAACGTTTCCGATAATGTTTAATCCCGTGACGTGGG
ATGCTCACACGTTTCCGGTTTATTTTGGAGGTACCACGGTTAGCGAAGATGGAATCATAACACACGTACCGAGCGTACAA
TTGGTTTATTTTGTTACGGCAGACAATGAAAAACAAGATGCCAGGGGAGCAGCATGGGAAGAAGCATTTTTAGACGCGAT
CGGAAAAGCAGAAGAAGAACACACGTTCAAATACATTTCTACGGCAAGATTTGCATCGAGAACTTTGGATATAGAATTGG
AAAGAAATACGCGAACGGTTGTACCTTATTTCGGTTCGACCTTTGCCCTCATGATTTCAATGATCACGTGTATGATGTTC
GATTGGGTTCGATCAAAACCTGCATTAGGATTAATGGGTAACATATCTGCTGCAATGGCAACAGTTGCCGCATTCGGTTT
TGCCATTTATTTAGGATTCGATTTTATCGGTATTAATTTGGCAGCACCGTTTCTCATGGTTGGAATCGGTATAGATGACA
CGTTTGTTATGTTGGCTGCATGGAGGAGGACATCAGTTACAAAATCCGTACCTGAAAGAATGGGACATACGTTAAGTGAA
GCTGCCGTATCAATAACAATAACTTCTCTCACTGATACCGTCAGTTTTTTCATCGGTGTTTTCAGTCCATTTCGTTCCGT
ACAATTATTTTGCATATATTCAGGAATAGCAACAATTTTTACCTTTTTATGGCACATAACATTCTTTTCCGGTTGTCTGG
CTGTTTCCGGTTATTGCGAAAATAAAAATTTACATTCCGTATTTTGCATACCCGTACAACCAAAATCTCTTTCGGTTAAC
AGGCATTGGTTGTACAGAGTTTTTTGTGCAGGAGGTATCAATCACGAAGATCCAAATAATCCGATGGATAACAGCGAACA
TATGATTATGATATTTTTTAGAGATCACGTGGCTACTTTTCTTAATAAGTGGCAAGTCAAAGTCATGGTTTTATTAACGT
TTGCCGTTTATTTAATGGGTGCTTGCTATGGTATAACAACACTTAAAGAAGGTTTACAAAGAAGAAAATTATCTCGAGCC
GATTCATATTCCGTTGAATTTTACGATCGAGAAGATTATTATTTTAGAGAATTCCCATATAGAATACAAGTCATCGTTTC
TGGAGAATTAAATTATTCCGATCCGAATACTCAGGATGAAATTGAAAAATTAACACAAACGTTTGAAAATTCTTCCTTCG
TATCGAATTCTCTATACACAGAATCCTGGGTTAGATCTTTTACAAGTTACATACGAAGAAACGGTGATTATTTAAACGTA
ACCATTGATACAGAAGAAGATTTCATTGAAAATTTAAAATCGCTTTGGCTTTTCAAACCCAATCCGTTTTCTTTGGATGT
TAAATTTAACGAAGATGAAACAAAAATTTTGGCATCGAGATTTATGATTCAAGCCATTAACATTACCGATGGTAATCATG
AAAAAGAAATGGTACAAGAACTCCGAAGAATAGCACATAGCAGTCCATTAAACGTCACCGTTTTCCATCCTTATTTTGTT
TATTTCGATCAGTTCGAACTCGTTCGACCGACGTCCATACAATGCATGGTAGTAGGTGCTATAATAATGATGATAATATC
ATTTATTTTCATACCCGATATGATTTGTGGAGTTTGGGTTGCGTTTTCGATAATTTCAATCGAACTCGGAGTGGCCGGAT
ATATGGCTTTGTGGGATGTTCGTCTCGATTCCATTTCCATGATTAATCTTATCATGTGCATCGGATTTAGCGTTGATTTC
ACTGCGCATATTTGTTATACGTATATGAGTTCTTCAGAGAAAAATTCGCAGGAAAGAGTTAAAGACAGTTTATATTCATT
AGGTCTTCCGATTGTTCAAGGAAGTTTTTCAACAATTTTATCAGTTTTTGCCTTGATCTTAGCCGATAGTTATATATTTT
TGGTATTTTTTAAAATGGTGTTTTTGGTCGTCTTTTTCGGCGCTATGCACGGACTCTTCTTACTTCCTGTTCTGTTAAGT
TTGTTCGGACCTGGAAGTTGCACGCGAAGAAAAAAAGACAAAGTATCAAAAGTTGAAAAAAGCTTGCCCTATCCTTATTG
CATTCCACACCCGAGTTTAATTTCAACAAACTGGGGAGAGCCACAACCGCAGCAGAAAAAAACTGACTGGGATGTTTCAG
AGAAACAAAATAACAACTTTTTATCAAACAGAGCGACAATGCCTTATTTGCCAAATTTACCTTCTCATATGATATTAAGC
ACATATGAAAGAAGTAGTCCGATGTTGGAAAAAGATTTAGGACTTGGAACGTCTGGAGAAGAATCAAGTGAAACAGCCTC
AGGGTCCGGACAATTCGAAGTAACGAAGCAAGGGGATAAACGACACAGAGGATTTGAAGAAAATTGGAGAAAAACCGGAG
AAAAAAATTGGAATTATTGGAAAAATAAAGAGGGATATAATAATAATGCTTATTTGTCAGATGACACTACACGCCCGAGG
CATTTTAAAAATTTTGATTCGAATGACAAATACAATAGCTCAAAAATTGAATATATAAAAAGAAAAAAAAATGGTTCTGG
GAATCCGGAAACTTTAGAAAAATTAGAGGGTAATAAATTATATCGTGACAAACAAAAAAGAGAACGTTTTCAAGATAATA
ATAATAGGGATTTTACTAAAAATGAAATTAAAAAATTTTCCTATCCTCCAAAATCAGATGTTGTGTGGTATCACCCACAT
AACAGTAGGTATTCAAAAACTTATAGTATAGATGATAGTCAGTTAGAGGAAAGTAGAAGAGGCAAACAAATATTTCGAAG
GCTGTCTGAACATGAAACATATGCAAAATATAGAAATGGTTATCATCCCTCTCACAATTTTTAA
PEP:
>PHUM558900-PA
MGCGVTFVDKFLTRNFFRLGMFVGKNPGYFLIIPILVALLCLTGRFGRIIAIPRDKGDMLRVEIWKELRLLDELIQNTTA
EYEGETFTYREVCAKWINECFQNDILNLDYVMEDIESKELNLTFPIMFNPVTWDAHTFPVYFGGTTVSEDGIITHVPSVQ
LVYFVTADNEKQDARGAAWEEAFLDAIGKAEEEHTFKYISTARFASRTLDIELERNTRTVVPYFGSTFALMISMITCMMF
DWVRSKPALGLMGNISAAMATVAAFGFAIYLGFDFIGINLAAPFLMVGIGIDDTFVMLAAWRRTSVTKSVPERMGHTLSE
AAVSITITSLTDTVSFFIGVFSPFRSVQLFCIYSGIATIFTFLWHITFFSGCLAVSGYCENKNLHSVFCIPVQPKSLSVN
RHWLYRVFCAGGINHEDPNNPMDNSEHMIMIFFRDHVATFLNKWQVKVMVLLTFAVYLMGACYGITTLKEGLQRRKLSRA
DSYSVEFYDREDYYFREFPYRIQVIVSGELNYSDPNTQDEIEKLTQTFENSSFVSNSLYTESWVRSFTSYIRRNGDYLNV
TIDTEEDFIENLKSLWLFKPNPFSLDVKFNEDETKILASRFMIQAINITDGNHEKEMVQELRRIAHSSPLNVTVFHPYFV
YFDQFELVRPTSIQCMVVGAIIMMIISFIFIPDMICGVWVAFSIISIELGVAGYMALWDVRLDSISMINLIMCIGFSVDF
TAHICYTYMSSSEKNSQERVKDSLYSLGLPIVQGSFSTILSVFALILADSYIFLVFFKMVFLVVFFGAMHGLFLLPVLLS
LFGPGSCTRRKKDKVSKVEKSLPYPYCIPHPSLISTNWGEPQPQQKKTDWDVSEKQNNNFLSNRATMPYLPNLPSHMILS
TYERSSPMLEKDLGLGTSGEESSETASGSGQFEVTKQGDKRHRGFEENWRKTGEKNWNYWKNKEGYNNNAYLSDDTTRPR
HFKNFDSNDKYNSSKIEYIKRKKNGSGNPETLEKLEGNKLYRDKQKRERFQDNNNRDFTKNEIKKFSYPPKSDVVWYHPH
NSRYSKTYSIDDSQLEESRRGKQIFRRLSEHETYAKYRNGYHPSHNF
Swiss-ProtPatched domain-containing protein 3
SUPERFAMILYSSF82866  Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain superfamily     
Gene3DG3DSA:1.20.1640.10     
PfamPF02460  Patched; Patched family     
ProSiteProfilesPS50156  SSD; Sterol-sensing domain (SSD) profile.     
PANTHERPTHR10796

You might be interested in these researchers

You might be interested in these references