Warning! We strongly recommend Internet Explorer (9.0 and later) and Google Chrome for better display.

Gene detail [Fasta]

Species Pediculus humanus
GenePHUM032350
PositionDS235005:563130..567059[GBrowse]
VectorBasehttp://www.vectorbase.org/search/site/PHUM032350
Gene Expressionhttps://www.vectorbase.org/expression-browser/gene/PHUM032350
sequence mRNA:
>PHUM032350-RA
ATGGAATTTTCCTATTGGGTGTTATTATTAACATTATGCACCCATATACGATCGGAATATATTCCTCCGGGACCAAGGTA
TCAATGTCCGAAAAACAAAGCGCAATTATATCCATGCGTATGTGCAAAACCTGGAGAAAGAGGAGTGACGATCGTTTGCG
AAAATACAAATTTGGCAAGTTTAAGCGTCGGACTTAAAAATTTTGCTAATGAAAATTTACTCATTGAAAAATTATATTTT
TCTAAATGTAACATAGGAAGATTATACGGGGATGTTTTACACAATCTTAAAATCCGAGTATTCGAAGTCGTCGATACGCC
ATTAACGATTATCGAAGATCATTTTTTTTTAGGCGTTAACAAAACACTACAAGAACTTTATTTATTCGATACGAATTTTG
AAAAATATCCAACAGAATCATTACAGATTTTAGGTAATTTAACGATTTTAAACATTCGCGGACATTTTATAAAAAATTTA
AATTCGAATACTTTTTCATCGTCTCTAATGAAAAACACGTTGGAAAGATTACACGTGACAAATGGCAAAATAACTGAATT
ACCATCGGATATGTTTACCGGTTTGAAAAAATTAAAAACTTTAGATTTTCACATGAATAATATAAAGGAATTAAAAAGGA
ATCAATTCAAAGGTTTAAGAGATTTAGAAGTTTTGGATTTAAGTTATAATAATTTGACCAAAATTGACGCCTCTCACATG
TCAGATCTTAACAAACTCGGATGGTTTAACGCATCGAATAATGCAGTCAAAGAACTCACAAGGGGAGCATTTGCTCGTAA
CACAGTATTAAAATATCTTAATTTTAATAATAATCTTATAAAAAAATTAGATTCTAATTCGTTTCGAGGTATGCGTTTTA
TACGAAGACTTTTATTTCGCGACAACGAAATATCGGATGTGGGTAGGGGTACTTTCGGATCCGTAACTCGTATAGGTACT
ATCGATTTATCGAAGAATAAAATAACAAAAATCGATTATCAAATGTTTTATCAATTGAATTACGTTGAAATAATCGACGT
GTCGGAAAATTTAATTACCGAAATACAAAAATTAGCATTTAAAGATTTATATTTGGTTACGATAAACGTTTCCCATAATT
TGATAAACAACATAGAAGGCGGTGCTTTTGAAAATTGCGCAAATATAACACTTTTGGATTTGAGTCACAATAAAATATCA
GAAATCCCTAAAACTGCTTTTGATAGTACCACCTACGCCACCCACTTGGATCTAAGTTATAATAATTTAACATCGCTTAA
TCAGGTACCACTTCAAAACATGACGGGATTGAAAATATTTAACGTGTCTTATAATCAATTGAAAACAATACCGAAAAATA
CTTTTCCGAAATTATACGAATTGCATACGATTGACGTGAGTCACAACGTCATAAAAGATGTTTTCAATGGCGTCTTTCAG
GTTTTGTTAGGTTTGAGATATTTAAATTTAAGTCACAATAAATTGGAATCGTTAAAAAGTTCTGTTTTCGGTGCACTACC
GACTCTACTACAACTCGACATAAGTAATAATAAATTAAAAGATATAAGTCGAGGAGCTTTGACGAGAATGGCAAGCGTGA
GACAATTAAACGCTCGTAATAATGAACTAACAAAAATATTTCAAATCCCGATATCCCTATCGGAATTGGATATATCCTGG
AACAAATTGGAAAAAATCCCGGCATCACACGAAACATGGCCGACGATGAATTCATTACTTTCGTTGGATTTAAGTTATAA
TTTATTACAAGATAATTTAGAAAAAGGAAGTTTCGAGGGTTTGTTAACATTACAAAAGTTAAATTTAAGTTATAACGATA
TTAATAATCCACCATGGTCAAGTTTGGGGGATTTATCATCATTGCAATATTTACAACTTCAAGGAAATAATATGACGACG
TTAGAAAAAAGTGCTTTCGGACGACTTCCGGTTGTTTTTGAATTAAATTTATCTGGTAATAAAATATCGAACGTGTCTCA
AAGAGCTTTCGATGGTCTTCTACAACTTCTTAAATTAGATTTGAGTCATAATAATTTAACAATCATACCCAACGGTGCAT
TTCAAGGTTTAGTATCTTTAAGAGAATTAGATTTGTCGTACAATCGTATAGAAAAATTAGACAACAAAACTCACGGACTT
TTAGACGATTTTTTATCACTCGAAAAGGTAAATTTAAGTCACAATAAAATATCTTTCCTCACTAGAAAATCATTTCCCAG
TAGTCCCTACATTCCATATCATTTAAGAATCATTGATTTGAGTTATAATTCACTTCCGGTTATAACGTACGATCTAACGT
ATGGGACTAAAGATGTTGAATTAACGGATTTTCCACCCAATTATTTCGGTCCCCCGGAAAATCTCACCGAATTATATTTA
TCGAATAATAAATTATACGTTTTACCATTGAAAGAATTATCGAAATTAAAATCGAAAATACGTCACGTGGATTTAAAAAA
TAACGAATTGAGTGAATTTTATCCCGAGCTCATGATGCTATTAAATAACGGAACTTCATTTCAATATTCAGGGAATCCCC
TTCAGTGTACCTGTCAAACACGACCTTTAAATAGGTGGATACGAAATCAAGTCGACGTTCCAAAAGAATGGAAAACCGTT
AAATGTTCCGGACCTGAACCTTTACAAGATCAAACGTTTTACCTACTGAAAGAATCAACTTTAACATGCCAAAGAGATGA
CGATAACAATGATCATAATTATAATTATTACGACGAAGATGAAGAAAATAATAATAATAATAATAAATTAATAAACGAAG
AATATGAAATAAATCCCGATATTAAATTTCGACAATTTGAATTGTGA
PEP:
>PHUM032350-PA
MEFSYWVLLLTLCTHIRSEYIPPGPRYQCPKNKAQLYPCVCAKPGERGVTIVCENTNLASLSVGLKNFANENLLIEKLYF
SKCNIGRLYGDVLHNLKIRVFEVVDTPLTIIEDHFFLGVNKTLQELYLFDTNFEKYPTESLQILGNLTILNIRGHFIKNL
NSNTFSSSLMKNTLERLHVTNGKITELPSDMFTGLKKLKTLDFHMNNIKELKRNQFKGLRDLEVLDLSYNNLTKIDASHM
SDLNKLGWFNASNNAVKELTRGAFARNTVLKYLNFNNNLIKKLDSNSFRGMRFIRRLLFRDNEISDVGRGTFGSVTRIGT
IDLSKNKITKIDYQMFYQLNYVEIIDVSENLITEIQKLAFKDLYLVTINVSHNLINNIEGGAFENCANITLLDLSHNKIS
EIPKTAFDSTTYATHLDLSYNNLTSLNQVPLQNMTGLKIFNVSYNQLKTIPKNTFPKLYELHTIDVSHNVIKDVFNGVFQ
VLLGLRYLNLSHNKLESLKSSVFGALPTLLQLDISNNKLKDISRGALTRMASVRQLNARNNELTKIFQIPISLSELDISW
NKLEKIPASHETWPTMNSLLSLDLSYNLLQDNLEKGSFEGLLTLQKLNLSYNDINNPPWSSLGDLSSLQYLQLQGNNMTT
LEKSAFGRLPVVFELNLSGNKISNVSQRAFDGLLQLLKLDLSHNNLTIIPNGAFQGLVSLRELDLSYNRIEKLDNKTHGL
LDDFLSLEKVNLSHNKISFLTRKSFPSSPYIPYHLRIIDLSYNSLPVITYDLTYGTKDVELTDFPPNYFGPPENLTELYL
SNNKLYVLPLKELSKLKSKIRHVDLKNNELSEFYPELMMLLNNGTSFQYSGNPLQCTCQTRPLNRWIRNQVDVPKEWKTV
KCSGPEPLQDQTFYLLKESTLTCQRDDDNNDHNYNYYDEDEENNNNNNKLINEEYEINPDIKFRQFEL
Swiss-ProtChaoptin
SUPERFAMILYSSF52058  L domain-like superfamily     
Gene3DG3DSA:3.80.10.10     
PfamPF13855  LRR_8; Leucine rich repeat     
SMARTSM00082     
ProSiteProfilesPS51450  LRR; Leucine-rich repeat profile.     
PRINTSPR00019     
PANTHERPTHR24365:SF83
OrthologiGroup-00231    Chaoptin      

You might be interested in these researchers

You might be interested in these references