Warning! We strongly recommend Internet Explorer (9.0 and later) and Google Chrome for better display.

Gene detail [Fasta]

Species Pogonomyrmex barbatus
GenePB17813
Positionscf7180000350235:114619..123501[GBrowse]
Ant Genomes Portalhttp://hymenopteragenome.org/cgi-bin/gb2/gbrowse/pbar_10/?name=PB17813
sequence mRNA:
>PB17813-RA
ATGGATATAATAAGAGAACATTTACTGGTACCAACGAAATATATGACATTAGCAGATGAAAGAATTTGCTTGACAATTCA
CAAAAGCTGGCTATCTCGATTTTTAACGGTTGGCCCATTTACATTTGTCAGTCATGATCGTCTATCTAAAGATGAAATAG
CAGCACAGCCTAGTATTGATGAATTGGGTGATGATTGGTTGAAAGTTTACGCAAAAGTATATATAAAGCAATATAAAAAT
GCAATTCCTTTACCAAGAGGAAGACCTACCAATACTAGTACAAAGGATCAAGCAGAGTTAATGTTCTCGCAATTGCTGCA
TTATGTAGCTGAAACCAATTATCGAAATCTATGGAAAGAAACATATAAGAAATATTACAACCCTTGGAATTTTGTTGAAC
AAAAAGAACAGTCTAGTATAACTGCTAATGTAAGTGATGTTACTATTATGCATGAAATATTGAATAGAATGTATGGATGT
ACTTTGATACAAGTGGAACATGGTATAGTCTTGTCAGTATCCAATGGTAGATTATCTGAAATACATTGCAATCTTGTACC
AATTCATTATGCCATAGAAACACCATCTGCATTTATAATGCTTTATGAGCAGACTGCCAATTACTCTCTTCGCGAATGTG
TAATGTATAGTCCTGCTGCTCTTAATACAAGTCATGGAAAACCATTATTTGTAGTTTATCAACTATTGAGATTATCCAGA
GACTTACATGATTGTGGTCTTGCATTAGGAGGGATTACACTTAGTGATATACTAGTCACAGACGATTTTACTATTCAGGT
ATTACCAAAGTTAGATGATAATATTTATCTAAAACCTGATCATCAATATATAAATGTTTCTCAAGAAAGTAAAGAAAAAA
ATTGGGATAGCAGTGCTTATGGTAAAAAAAATGGTATATCTTGCTCAAATACTGACTTTGGTTTAAATAAGAATATTGAG
GAATTGTGTGAGATGTGGATGTATAATTGTATTAGCAACTTTGATTATTTAATTGCGCTTAATAATTTGGCTGGAAGGAG
ATATGGTGATCCTAGCTGTCATCATGTTATGCCTTGGGTGACAGACTTTACTTCTAGAAATGGTGGAAACTGGAGAGATT
TGACAAAGTCAAAATTTCGATTAAACAAGGGAGATAGGCAACTGGATCTTACATTTGATTCACAGTCAACTGAAGTTGGA
CACCATGTATCTGATGTTTTGTCAGAGATTACGTATTATGTATATCTTTCACGTCGATATAATAAATCTGTACTTTGTAA
ACATGTACGACCTTTGTGGGTACCTGGAGAATACCCGGCTTCAATTCAAAGATTATATGATTGGAGTCCTGATGAATGCA
TACCACAATTTTTTACTGATCCAAATGTTTTTAAGTCCATTCACGAAGATTTACCAGATTTAGAAATTCCCGCATGGGCG
ACTTCTCCGGAGGATTTTATTGAAAAACATAGAGAAGCGTTGGAAAGTTTTTATATCTCGGAAAGATTACATCACTGGAT
AGATTTAACTTTTGGATACAAATTGTCTGGTTCGGCTGCCATAAAATCAAAAAATGTTTGTCTACAGTTAGTTGATAATC
ATACTGATTTAACTAATTCTGGTGTTGTACAACTTTTCACACAACCACATCCACAAAAAATTGTTCCATCTCCTTATTGG
GGTAAAGTTCCACCACGTCTTCGACCAATACCTTCGTCTAATAAGAATAAAAGTGATCAACTTGCTAATCGAGTCAGCGA
CGACGAAGGTCACAGTTCTGGTATTGAAGAAGAAGAATTATCTGTGACAGTAACGAATACATCAAAATCATCGCCTCTTG
TGTTGAGTCGCTTGTTGAGTCGTTCCAGAGGTTCTTTGCTTTCGGAAGATAACATTAAATTGGATAAATTCATTAATCAA
TCTATTATTCTTCCAAAGGATTTTAATCCTGTTGCAGCCCTCATACAAGTGGAAACTACACATACTTTTATGCATAAGGT
CAATCATAGGATTTACAAACCTGCAGTGGTATCACAAGATTTGTCTACGAATTACAAGCAAATTGTGGCTGGTGGACGTA
TTAAGGAACAACAGATACTTGGTTGTCTAATAGTAGAGATATTTCTAGCTGGCAAATTTCGTGCAATTTGGAATGTTGAA
AAAGTATCATTTGCGCAAAGATTTGCAACGTGTCTAAATATTTTGAAGACATCAGCAGATAATTTACCGAAATGTATAAG
AAACATTGTATCTTTGTTGTTACAAATCGACATTATGTCAAAGAGTTATAATATAGGCAATGTAGAAATGAATGATATTT
CAACGATGAATGAAACTCCTTTTCGTTATCCCACAATAACATACATGGGCCTTCCACCACCATCTGCGCATCAATTTCTT
CAACCAATTTTATCTGGTAGTCTGTTCCCATTCTCTAAATATTGCCAATATTTATATAACATTGTGGAAATGTTGCAAGA
ATACAATGGTTTGGTACAAGAATTAAATTCTATCGTGAAGAATGAGGACGATATGGATTTTGCAATAAAAACAAAGATAA
AGTATCTGTGTAAAATTAATGAATGCAAAGTAAAAGCGATTGCTAGAGAATTAGAACATTTGTTACCATATACTGATGGT
ATGAGAGAAGCCACTTTGCAATTGATAGTGCCTCATATAATACGAATTATGGAAGAACCTTATAGTGCAGTATTAGCAGT
ATGGCATCTTTTTGATCCTATCGCAAAAACATTGGGCCCAAAAGATACAGCCGATACATTCCTTTCACCTATTATAAAAT
TATATGAAAATGGTTCTATCATGGATACTACCATATATACTGATATAATATCTGCAAACACACTTGCAAAATTTCGAACT
ACCAGATTATATCATAGAACATTCTTGCTGAAATTGATAGTCAGATTGGGACTACGTAGATTTTTAGACAATTTTATCAA
CTCTCTGGTAGAAGCAGTGGGAGGATACAAAGATTATGTACAAGGCTCCGTTGAGACATACACACACAGGACTGTAAATT
TAAAAAGCTGTGACTTAAGTGGACCCTGCAGTGAGGGGGAAGGAATTTTATCTCCCCTAGATGAAGATTCCTTTACAGAT
ACTGAACGTAATGTTGTCCAACCAACAACCAATGATCATATATTTAATACAATGACAGACAATGATATTGAAGAAGTATT
TACTATGGAAACAGAGGATAATTCATGGATTTCTTTAAATAATACTGCACCATATGATCTACATATAGATCTACATATAG
ATCTCAATCTAAATGTTTGCGATGATTTAAATGATGATGGAAACAAAAATTCACCGAGTGGCTCTATCAAATCACCAACA
ATTCCAATACCTAAATCAAATACCAGTGGGACTAAGTTAGTAACCGAATTTAACAGTATTGGTTGCAATGTCGGCAGTAA
AACTTCCAGTGAAGATTTTACTTATGTTAGCGCATATTCTAATATTCATTCTGATAGTAATCATTCGGAAAATATATGCA
ATATAGATACTAAGGAAGACAATTCTGCTATGCTTCCCGTGGAACAATCTGGGAACAAGTGCGACGCAATCAAATCCAAT
GAGAATCTACATCAATTGGATCATATTTATCAAAAATCTACTCCAAGTGAATGTACAATTTCCGAAATGAGTGCAGAATC
TGTTATTTGGCTATCTCATAGACTCGGCCCGGTATTAACGGCACGATACTTGTCACGCAATCTTCTAAGAATGCTTACGT
TATGTTACGCCGGAAAAGAAAATTTAACATCAATCGATGACAATAATTTCGTATGTTTGGAAGATGTTACATGGAAAAAA
CCCATATTAGCTGGTGATCAAAATGCTGTTAAGGTTTTAGAATGCCTCACAGCTATCGCAGGATTGTATGGAGAACAAAT
TATATTGCTGCAATATTTTGCACATATGGTTGAGCTATTAGCTTTGTGTAAAAGGAAGTTAACACAGAATTTGGAAGGAG
GTTTGATTTCTTGTTTGGCTCTATTAAATCACATTATAGCATATCTTAGCGATTCTACATTGATGGACGTGCTTCATGAA
CCGATCGTTAAATCCATTTTGCATCCCACAGTACGTATACTTTCAACCGCGAGATTTACATTTTCAAATGGAATACTTGC
ACGTGCTGCTTTGGCTGAAAAATGTTTAGAAGCGATGTTTACTCTTAGCTTACGACTTGGCAGTGTAATGACGAAAAATC
ATTTAGCAGTGCCAATTCAACGTTTCTTTCTAGCCTTTGACAAAGCTTTCAATGAAAATATTGACAACAGAATTTCATCA
GATAGTTTAGAGCAAAAAGTAGACGTAACCTGTGAACATTTTATACGGACGAAAGAAGAATCTGTTAATAGTGGAATTTA
CATATGGAACAAACTTGATACAGATATTGCAGATTCGTATTCCCCTCCCGTTGTAAAAAACGACATACCGGATTTACAAA
GAAATAGAGCATTTGAAGAATTACGAGCTGTATTCACCACTGAGTTTGCTCATAAAGCATACATGCTTTTTTATAGATGT
GTAGATACTGAAATGATGGAGCATATTCTCAAAAATCACGAACATATACAAGAACTTTGTCACGATTACGAACAAAAAAT
AAAAGGGATTTCAGCGAGCAATGATAATATGGATAAGTGCAATACTTCCGTGGATTGCGACATAGCAGAAAATGTAGAAT
CGATTGATAAAGGCGTTTGCAGCTTTGGAAATATATCTGTGATAGGAAATAGATTCGAGATACAGAAAGATGATACAAAA
TCCCAATCAGCAATGGAGACGAATGTTGCTGCTAATCGTGAGACAACTTGTCTATTATCTGCTGGCAGACAACTACGCGG
TAATTGGCTGGCATATTGGGAGCATGAGATAGGTAGACCAGAAAAAGATACAATATTTAATATAAAGCAGATAAAACTTC
AGACTTTCAACGGACATACAAATAGCGTAAGATGTCTTTACGTGTTAGATAATGAAAATAGTTTTATGAGTGGTGGCAGA
GACAAAACTGTAAAATTATGGAGTTTACGAAGCCAGGGTGATGGAAATACAATCTCATCGTGTCAATATACATATACTGG
ACATAAAAAGTCTATTCTATCTCTCACATTCTTAGAATCTTTGAGATACGCAGTAACATGCGATGGAGTGATTCACTGTT
GGGATCCTTTTATGGGTTCGCTTCTGGGATGTCCAGAAAGTAATCGTCCTTTACCTGTGAATACTTTAGCCTCAAGTCCT
TCTCCATCTACAACTCTTCTTGCGGGAACAACTGACATTACCCTTAGAGTTATTGATTGTAGAACATTCCAATACGTCAA
TGAAATGAAAGTTTCTATGAATCCAACTGGTTTAATAAGATGTATCGCAGTATCTCCTAGTGGTAATTGGGTCGCTTTAG
GTCAAGCGTCAGGTTTTTTAACAATACTTGATATTCGCACTGGTTTAATTATCGCATCTTGGAAAGGACATGAATGTGAG
ATCCTGCAATTACAAGCGATAAATGAAACTACCATAGTGAGTTCTTCTTTGGACCAAACTATAGCTGTGTGGAGTGCAAT
AGATGGAAAACTCAAATTTCACTTGAAAGGTGCAACAGAACCTATTCATTGTATGGCAATGCACGAACAGGCATTAGTGA
TAGGTACAACGGCAAATAGAATTGGCGTCTATACCGCTGTAGAAATGACAGCTTCGTTAAGCTCATCCAAATTGAAATCT
GATGCTTTTAAAGGCATTCTTACTGCCATGGCTATTCTTCCTCTCAATCAGTTATTGTTATTAGGCGCCGATAACGGTGT
AATTACGCTATTATGTTAA
PEP:
>PB17813-PA
MDIIREHLLVPTKYMTLADERICLTIHKSWLSRFLTVGPFTFVSHDRLSKDEIAAQPSIDELGDDWLKVYAKVYIKQYKN
AIPLPRGRPTNTSTKDQAELMFSQLLHYVAETNYRNLWKETYKKYYNPWNFVEQKEQSSITANVSDVTIMHEILNRMYGC
TLIQVEHGIVLSVSNGRLSEIHCNLVPIHYAIETPSAFIMLYEQTANYSLRECVMYSPAALNTSHGKPLFVVYQLLRLSR
DLHDCGLALGGITLSDILVTDDFTIQVLPKLDDNIYLKPDHQYINVSQESKEKNWDSSAYGKKNGISCSNTDFGLNKNIE
ELCEMWMYNCISNFDYLIALNNLAGRRYGDPSCHHVMPWVTDFTSRNGGNWRDLTKSKFRLNKGDRQLDLTFDSQSTEVG
HHVSDVLSEITYYVYLSRRYNKSVLCKHVRPLWVPGEYPASIQRLYDWSPDECIPQFFTDPNVFKSIHEDLPDLEIPAWA
TSPEDFIEKHREALESFYISERLHHWIDLTFGYKLSGSAAIKSKNVCLQLVDNHTDLTNSGVVQLFTQPHPQKIVPSPYW
GKVPPRLRPIPSSNKNKSDQLANRVSDDEGHSSGIEEEELSVTVTNTSKSSPLVLSRLLSRSRGSLLSEDNIKLDKFINQ
SIILPKDFNPVAALIQVETTHTFMHKVNHRIYKPAVVSQDLSTNYKQIVAGGRIKEQQILGCLIVEIFLAGKFRAIWNVE
KVSFAQRFATCLNILKTSADNLPKCIRNIVSLLLQIDIMSKSYNIGNVEMNDISTMNETPFRYPTITYMGLPPPSAHQFL
QPILSGSLFPFSKYCQYLYNIVEMLQEYNGLVQELNSIVKNEDDMDFAIKTKIKYLCKINECKVKAIARELEHLLPYTDG
MREATLQLIVPHIIRIMEEPYSAVLAVWHLFDPIAKTLGPKDTADTFLSPIIKLYENGSIMDTTIYTDIISANTLAKFRT
TRLYHRTFLLKLIVRLGLRRFLDNFINSLVEAVGGYKDYVQGSVETYTHRTVNLKSCDLSGPCSEGEGILSPLDEDSFTD
TERNVVQPTTNDHIFNTMTDNDIEEVFTMETEDNSWISLNNTAPYDLHIDLHIDLNLNVCDDLNDDGNKNSPSGSIKSPT
IPIPKSNTSGTKLVTEFNSIGCNVGSKTSSEDFTYVSAYSNIHSDSNHSENICNIDTKEDNSAMLPVEQSGNKCDAIKSN
ENLHQLDHIYQKSTPSECTISEMSAESVIWLSHRLGPVLTARYLSRNLLRMLTLCYAGKENLTSIDDNNFVCLEDVTWKK
PILAGDQNAVKVLECLTAIAGLYGEQIILLQYFAHMVELLALCKRKLTQNLEGGLISCLALLNHIIAYLSDSTLMDVLHE
PIVKSILHPTVRILSTARFTFSNGILARAALAEKCLEAMFTLSLRLGSVMTKNHLAVPIQRFFLAFDKAFNENIDNRISS
DSLEQKVDVTCEHFIRTKEESVNSGIYIWNKLDTDIADSYSPPVVKNDIPDLQRNRAFEELRAVFTTEFAHKAYMLFYRC
VDTEMMEHILKNHEHIQELCHDYEQKIKGISASNDNMDKCNTSVDCDIAENVESIDKGVCSFGNISVIGNRFEIQKDDTK
SQSAMETNVAANRETTCLLSAGRQLRGNWLAYWEHEIGRPEKDTIFNIKQIKLQTFNGHTNSVRCLYVLDNENSFMSGGR
DKTVKLWSLRSQGDGNTISSCQYTYTGHKKSILSLTFLESLRYAVTCDGVIHCWDPFMGSLLGCPESNRPLPVNTLASSP
SPSTTLLAGTTDITLRVIDCRTFQYVNEMKVSMNPTGLIRCIAVSPSGNWVALGQASGFLTILDIRTGLIIASWKGHECE
ILQLQAINETTIVSSSLDQTIAVWSAIDGKLKFHLKGATEPIHCMAMHEQALVIGTTANRIGVYTAVEMTASLSSSKLKS
DAFKGILTAMAILPLNQLLLLGADNGVITLLC
Swiss-ProtU3 small nucleolar RNA-interacting protein 2
KEGG     K17601     
SUPERFAMILYSSF56112  Protein kinase-like (PK-like) superfamily     
Gene3DG3DSA:2.130.10.10     
PfamPF00400  WD40; WD domain, G-beta repeat     
SMARTSM01026     
ProSiteProfilesPS50082  WD_REPEATS_2; Trp-Asp (WD) repeats profile.     

You might be interested in these researchers

You might be interested in these references