Warning! We strongly recommend Internet Explorer (9.0 and later) and Google Chrome for better display.

Gene detail [Fasta]

Species Solenopsis invicta
GeneSINV12224
PositionSi_gnF.scaffold00655:432476..438782[GBrowse]
Ant Genomes Portalhttp://hymenopteragenome.org/cgi-bin/gb2/gbrowse/sinv_10/?name=SINV12224
sequence mRNA: 
>SINV12224-RA
ATGGCCTGTCAAATTAGAGGAATAGCAATCATACCAGATGTGAATACCGTTAAAAAATTGCTTTACGGCGATGCTATCAG
TAAATTCGAGTATATATCAAGCGATGAATTACCTCTTCAAGACTGTTGTATAGCTCTATCGTCGGTTGGAGATGTACTTA
CCATGGCTTGGAACACAAGAATGATCATATTTGTTTCAAAATGGGACTCGCAAGAATTAGATGAAGTAAAAAATAAATTT
CACGTAACGTGGCATGGAGAAGTAACAAAAGAAGCAAATGAATGGGTAACGTCAGTGATCTGCTTACCTTTAATATCCTT
GGGAAAGGCTACCGGTCCAGATTGGACCTGTATAGCTGTTGGATACAATACAGGTTTTGTTAGATTCTATACAGAAACAG
GTGCATTCCTCTTTGGGGAGCAAATACATAATGAATCGGTTCTAGGAATCAAGTGTCAGTCGTGTTGCTTACCCAAACAC
ACTGGAGACGCTGGTTCTAGTGAAGAAATATATATTTTATATAACAGTGGTGTTTGTATATTACAAGGATTTCCATTATT
TTCAACTTTACGCGCTTGTAGAAATCATTTAGCTAAAGTTCAAGCAAATTGCAACGATTTGCCACCGGTAACAAATTTAT
CTTATAAAAAATGGGCGTTTAAAAATCAAGATATTACAAACGATTTAGAAGTGATTGGTACAACGTCGATAAATAGTTTT
GATCATTTAATGACAGCTTCGATATGCGGTGGATATAACGCAATGTACAGATCCAGTGCACCACAACATAATTTAGTCCT
TGCGACAGGAAAACGACCATTTGTAGGATTCCATTATGCACTGGAAGGTGGTAATGCACCAGTCCTGTCGGATGTTGCCA
TCGCTATGGCTAGCAAACTGGCTAATGCTATCGGTACTGCTGTACCATGGTTTCGTGGAAAGAATGCAATGTCTGAAGCG
TCAAAGGGTATTAGCCATGAATCTATAGAGACAATGACGTGTCGATTTGGTTTGAGCGATATTATGAGGGAAGGTGATTG
TATCGTTTCTAGTCCAAATAAAATGTTTTCGGTAATATCGGACGCTATGGGCAGAGTAATTCTCTTAAATAATAAAAAGG
GCACAGCTGTAAGAATGTGGAAAGGATATCGCGATGCTCAGTGTGGTTGGATTGAAGTTACCGAAGAGAGAGATCGTGGA
GTACATAGGAATGTTGATAAAAAATCTGGACGTAAAGCTTTATTCCGTACCGCTCTGTTTTTAGTTATTTATGCACCAAA
GAAGGGTGTAATCGATATTTGGAGTATACAGCAGGGTCCAAAAATCACTACTTTCACTGCTAGCAAGAATGGACGATTAT
TATACATTAATTATGGTTTTCTTGGTACAAATGATAATGCCATTTTATCGAGAAATAAAGCGCAATACTCTTGCGTATTT
ATTGACCCACTTGGAGGATTAAAGGAGATTTGTGTTCCATTTCACTTTGCGCTTAATAGTAAAAATGGAAAACGGGCACG
CGACGTACATCTACTTAGAAAACTTAGAACGTTTCTGAGAGAGGAGGATTTTAACGAGGAGAAATTAGTTTTCAAAGTTA
CCGATACTTGTCTGGGTTTAGAAACAAATGAAGTTCGGATACAAACGATAGAGGTTTTAATGAACAGCAAGCATATTTTA
CCAGATGCTTTGCTTGCTGCAACCAACTGTTTTGCAGTAAAACTAGAAGGAGGAAGAAAAGAAGAGGAAGAAGAAAAATT
GGAGCCTACCGTCAAGATGCTTCATCAATTGACATTGCAATTACAACATATAATTACATTTTATAAATATATCGAGTCTC
AACTTGATATGCCACTCGAGTGCGATATTACAACAGTTAATAACGCAATAAGTGTTAAAAATTTATCTTCGATATTATCA
ACTTCGGAACGAGAAGTAAACCGTGTTACCAAATTGGCTAAAATATTAAACAACCTAACGGATGATAACGTTTCTGCGGA
AACTAAAGTGAAATTTAAGGATGAAAATGTATTCTTTGACTTTTTATCGTGCTTCGAATTGGGCAAATCGAGATTGATTG
GACTACGAAATGACGTAAAAGAAGAAAATGTATACAAAATTTCACGATTGATATATCGAGGACCGATGTCGTCCGATGAT
ACGAAAGAGAAATGGCAGCAAGCTGCTAAAGAAAGTAACATTCAACCGTTTATCTTTATGCGACTGGCATTAATATATTG
GATGCACAAGGAGGAAGCTGAGTTTTCGGAAATTGAATTAAAACGCTTTACGCAGCTGCTGCATCTAATTTGTTTATTAA
CTGATGTGGAAGAGATATGTGTCGAATATAACGAGGTTTCTTCGTGGTGGAAAGACGTACGCACTATTCTGATAGAATCT
ACGAAGCCTTTCAACGCGTTTACCGCTGCCTTAGCATGCAGGGCAACTGCTATGATTCTAGACAAGTATAAAGAAAAATT
ACAAAATGAAAAACAATTTGGTAATAACGGAAACGAGGAGGAAGAGGATATTAAAAATGGAAATAATACAACTAAAATAA
ATGAACTGGAGAGTAAGTCGAATGAGGTGACACCGGACGATGAAACGTACAGTTCGATTAGTGAATGGGAGAATGTCAGT
AATGACACTTGTCAATTCACACTGTTGATCGGGAATCTTGAAGACATCGCTATTTTGAATGCTGTTACTAGTCAGCGAGT
TGTATCGGATGAGACGACGCAATTTTTTGCTCTACCATTTACAAGGCACGACACTTGTTTAGCATCGATTCTCTCTAGGG
GAAGAGGCTCAGTGTCTGAATTGGTTACAAAGTGGCTCAGCACCACGGGTATCGATCCAGCGCGGTTAATCGACACGACG
GACGTAGAATTCGATCAATTGCAATTATCGGTAGATAATTCTTTACAATTGTCCGATACGCTGAGTAAAGCGACTGCTGT
TCGAATACCTCGACAAGAACGGACGAAACTTGTTTCTTTATCGATCGAAATCGAGGACGAAGCAAAAGTTAACGCGACTG
CGGAAGCGTGCATTTTAGGCAAGCACAATATGGCCCTGCTCAAACGCCATTTTCCATACAGTTTAACGAGCAGTGTCTTA
TTAGCCAATTTATGCTGGGAGTTTGCCATGTCGTGGGATAAGGAGATTACTCGGCTCGATTCACTCGCAGCTGCCTTGAC
CGTTTTAAGACAAATACCCATGAAGAATATGAGGCATGGCGTCTGCTGTCTTTTGTGGACACTTCACATAAAGAAAAGAA
TGGAAGCGGCGGCCAAATTGATGAACAAACTCGGAAAGTTGCCAAAGGAGAGATTATGCATGCAAGATATTGGTTTATCT
GACATTCAAGTGACAATGTTTTTACAACACTGCGTTACCTTCTTGGATATATTTCTCGATACTGAGATACTCGAACGAGG
AGACAGTACGGTAATAAAATCGGAAGAATTGTGGGACGGACATCTCGGTGGACCGCAACCGTTTGCCGCACTAGCCATCT
CCCAGACTCCAGCTTGGTACGACTTGATTTTGTTACACGTTCAAGTGGCTAATGTCCTATATATGATGGCGTGTCTCAAC
TTGAAAATGTTGAAGCCATTAAATAATTTGTTCGAATCCGTGGTACAGCCCTATCTCTTTCAAGATATAACGGACAAAGT
GATGCTCACGTGGTATCGAGATGACAAGAGGGATAATATACGTACAGAATTTTTGTGTAGAGTAATTACAGCATCGATGG
AATTTATTCATCGGGAAACTACCGACGGCGTGACGATTAGTTCGACACAGGCCATCTCGTGGATGAGCAAGTGTCAAGCA
TTAGCATCTATCTGGAAAATTAATAATGACGAATTGAGGATACATCAAGCCTGTCAGCTATACATAAACGGTTTTGATCG
TTTGGCCGAAGAGGTAACTACAGCGGTAACCGATATCGAACGGTTGGCTGCAAATTTATTGCCTACAGCTGGAAGAAGAA
TGATGGCATATCTCTCTAAAACGCCTAATCTTCTGGAAGAAATGTCCCGAATGAGTCCAGCGCTTACAAGATACTTGGAA
AGCCTGAACATGCCTGAAATAATCTGTACAAATTGTTCGAATGCCGACACTGTGGAGTTGATTCGCCGAGTATCTGTGCA
TTTACCTAAAACTCACTGTGATTATCACATTATGGTGTTAATGTTAGACGCAACATTTATTTATAAA
PEP: 
>SINV12224-PA
MACQIRGIAIIPDVNTVKKLLYGDAISKFEYISSDELPLQDCCIALSSVGDVLTMAWNTRMIIFVSKWDSQELDEVKNKF
HVTWHGEVTKEANEWVTSVICLPLISLGKATGPDWTCIAVGYNTGFVRFYTETGAFLFGEQIHNESVLGIKCQSCCLPKH
TGDAGSSEEIYILYNSGVCILQGFPLFSTLRACRNHLAKVQANCNDLPPVTNLSYKKWAFKNQDITNDLEVIGTTSINSF
DHLMTASICGGYNAMYRSSAPQHNLVLATGKRPFVGFHYALEGGNAPVLSDVAIAMASKLANAIGTAVPWFRGKNAMSEA
SKGISHESIETMTCRFGLSDIMREGDCIVSSPNKMFSVISDAMGRVILLNNKKGTAVRMWKGYRDAQCGWIEVTEERDRG
VHRNVDKKSGRKALFRTALFLVIYAPKKGVIDIWSIQQGPKITTFTASKNGRLLYINYGFLGTNDNAILSRNKAQYSCVF
IDPLGGLKEICVPFHFALNSKNGKRARDVHLLRKLRTFLREEDFNEEKLVFKVTDTCLGLETNEVRIQTIEVLMNSKHIL
PDALLAATNCFAVKLEGGRKEEEEEKLEPTVKMLHQLTLQLQHIITFYKYIESQLDMPLECDITTVNNAISVKNLSSILS
TSEREVNRVTKLAKILNNLTDDNVSAETKVKFKDENVFFDFLSCFELGKSRLIGLRNDVKEENVYKISRLIYRGPMSSDD
TKEKWQQAAKESNIQPFIFMRLALIYWMHKEEAEFSEIELKRFTQLLHLICLLTDVEEICVEYNEVSSWWKDVRTILIES
TKPFNAFTAALACRATAMILDKYKEKLQNEKQFGNNGNEEEEDIKNGNNTTKINELESKSNEVTPDDETYSSISEWENVS
NDTCQFTLLIGNLEDIAILNAVTSQRVVSDETTQFFALPFTRHDTCLASILSRGRGSVSELVTKWLSTTGIDPARLIDTT
DVEFDQLQLSVDNSLQLSDTLSKATAVRIPRQERTKLVSLSIEIEDEAKVNATAEACILGKHNMALLKRHFPYSLTSSVL
LANLCWEFAMSWDKEITRLDSLAAALTVLRQIPMKNMRHGVCCLLWTLHIKKRMEAAAKLMNKLGKLPKERLCMQDIGLS
DIQVTMFLQHCVTFLDIFLDTEILERGDSTVIKSEELWDGHLGGPQPFAALAISQTPAWYDLILLHVQVANVLYMMACLN
LKMLKPLNNLFESVVQPYLFQDITDKVMLTWYRDDKRDNIRTEFLCRVITASMEFIHRETTDGVTISSTQAISWMSKCQA
LASIWKINNDELRIHQACQLYINGFDRLAEEVTTAVTDIERLAANLLPTAGRRMMAYLSKTPNLLEEMSRMSPALTRYLE
SLNMPEIICTNCSNADTVELIRRVSVHLPKTHCDYHIMVLMLDATFIYK
Swiss-ProtRab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit
PfamPF14656  RAB3GAP2_C; Rab3 GTPase-activating protein regulatory subunit C-terminus     

You might be interested in these researchers

You might be interested in these references